Kun kalvoa varastoidaan pitkään, sen on säilytettävä hyvä suorituskyky ja sillä on oltava käyttöarvoa, joten vedenpitävän ja hengittävän kalvon käyttöikä on tärkeä asia. Siksi varsinaiseen varastointiin tulee kiinnittää erityistä huomiota. Vedenpitävän ja hengittävän mikrosuodatuskalvon säilöntä on jaettu kahteen menetelmään: märkäsäilöntä ja kuivasäilytys. Joka tapauksessa tarkoituksena on estää kalvon hydrolyysi, mikro-organismien kasvu ja eroosio sekä kalvon kutistuminen ja muodonmuutos.
Märkäsäilytyksen avain on, että kalvopinta on aina kiinnitetty säilöntänesteellä, kosteassa tilassa. Säilöntäliuoksessa voidaan käyttää seuraavaa kaavaa: vesi: glyseriini: formaldehydi {{0}},5:20:0,5. Formaldehydin tehtävänä on estää mikro-organismien kasvua ja lisääntymistä kalvon pinnalla sekä estää kalvon eroosio. Glyseriinin lisäämisen tarkoituksena on alentaa säilöntäliuoksen jäätymispistettä ja estää kalvon vaurioituminen jäätymisen seurauksena. Koostumuksessa oleva formaldehydi voidaan myös korvata muilla fungisidillä, kuten kuparisulfaatilla, jotka eivät ole haitallisia kalvolle. Selluloosa-asetaattikalvon säilytyslämpötila on 5-40 astetta ja pH=4,5~5, kun taas ei-selluloosa-asetaattikalvon säilytyslämpötila ja pH voivat olla leveämpiä.